La selección de fútbol sub-20 de Guinea-Bissau es el equipo representativo del país en las competiciones oficiales de fútbol de esa categoría. Su organización está a cargo de la Federación de Fútbol de Guinea-Bissau, miembro de la Confederación Africana de Fútbol y de la FIFA. Forma parte de la Unión de Federaciones de Fútbol de África Occidental. Su mayor logro fue el tercer lugar obtenido en la Copa Mundial Femenina de Fútbol Sub-20 de 2010.