Burgos

José María Quintano funda en 1985 el actual Burgos CF con la denominación de Club Deportivo Burgos Club de Fútbol, comenzando a competir en la temporada 1994/95 en la antigua Regional Ordinaria. Félix Arnáiz Lucas sería su entrenador. Lucas consiguió dos ascensos consecutivos y logró subir al equipo hasta la Tercera División. Para la temporada 1996/97 en Tercera División, se confía el banquillo al entrenador Martínez Lobato quien se encargaría de llevar al equipo hasta la Segunda División B en junio de 1997 en la localidad asturiana de Villaviciosa. De este modo, el club consiguió tres ascensos consecutivos entre 1994 y 1997. Esta misma temporada se consigue además la Copa Real Federación Española de Fútbol al ganar en la final a doble partido a la Unión Deportiva Gáldar por un resultado global de 5-1.

La temporada 1997/98 en Segunda División B fue una dura temporada en la que se consiguió la salvación en las últimas jornadas gracias al regreso al banquillo de Félix Arnáiz Lucas que sustituyó a tiempo a un Blas Ziarreta enfrentado con la afición.

En la temporada 1998/99, con Vicente González Villamil en el banquillo, el equipo comienza dubitativo y de nuevo Félix Arnáiz Lucas se hace cargo del equipo desde la jornada 9. El equipo mejora ostensiblemente y acaba 4.º, jugando finalmente la fase de ascenso a Segunda División, consistente en una liguilla con otros tres equipos más. UD Melilla, Elche CF y Universidad de Las Palmas son los rivales. Los ilicitanos son los que finalmente se llevan el premio del ascenso.

En la temporada 1999/2000, Félix Arnáiz Lucas dirige al equipo desde el comienzo de la temporada y el equipo acaba 3.º con Roberto Peragón como estrella del equipo. En la liguilla de ascenso, CD Mensajero, Real Murcia y Granada CF son los rivales. Los pimentoneros son los que finalmente ascienden.

Es en la temporada 2000/01 y con Carlos Terrazas en el banquillo, el equipo consigue ascender a la Segunda División. Queda campeón del grupo II de la Segunda División B y en la liguilla de ascenso Sabadell, AD Ceuta y CD Ourense son los rivales. El ascenso llega gracias al recordado tanto de Dani Pendín contra el CD Orense en la jornada 5 de la liguilla, partido disputado en el Estadio Municipal de El Plantío.

Descenso administrativo y posterior descenso a Tercera División (2002-2008)

Durante la temporada 2001/02, el Burgos CF mantuvo la categoría en Segunda División bajo la batuta de Enrique Martín, pero la obligatoriedad de convertirse en Sociedad Anónima Deportiva y la resistencia del presidente Quintano a realizar la conversión, llevó al equipo a descender nuevamente a la Segunda División B, sumiendo a la ciudad en una nueva decepción. José María Quintano dimitió tras el escándalo y la presión social. El equipo beneficiado por esta decisión fue el Levante UD que, tras haber finalizado 19.º en puestos de descenso, mantuvo la categoría.

Tras el descenso administrativo, el Burgos CF jugó la temporada 2002/03 en el grupo III sustituyendo al Levante UD y teniendo unos desplazamientos largos y costosos. Carlos Terrazas retorna al banquillo burgalés y se consigue hacer un equipo competitivo en pocos días. Valentín Germán es elegido presidente en las urnas y ese año el equipo acaba en 3.ª posición. En la liguilla de ascenso Algeciras CF, Bilbao Athletic y Zamora CF son los rivales. Los andaluces son los que finalmente ascienden.

En la temporada 2003/04, ya en el grupo II, el equipo acaba en quinta posición y no consigue clasificarse para la fase de ascenso, cosa que sí conseguiría en la temporada 2004/05. Con Fede Castaños en el banquillo, el equipo es eliminado en la primera eliminatoria del play off de ascenso por el Conquense. En esta temporada, el presidente Valentín Germán presentó la dimisión y convocó elecciones, siendo él mismo reelegido ante la falta de más candidatos.

La temporada 2005/06, comienza con un cambio de presidente en el club. Domingo Novoa Rey sustituye a Valentín Germán. Era la cabeza visible de un grupo de empresarios, entre los que se encontraban viejos conocidos como el que fuera preparador físico del Real Burgos Carlos Lorenzana o el también exfutbolista del Real Burgos e hijo del presidente Domingo Novoa. Se abre otra etapa en el club blanquinegro. Fabri toma el mando en el banquillo y consigue clasificar al equipo para el play off de ascenso. En la primera eliminatoria, el equipo es eliminado a manos del filial Levante "B".

En la temporada 2006/07, Gonzalo Arconada es el entrenador y se prepara un equipo con ilusiones de ascenso. Se consigue el fichaje del internacional Javi de Pedro por su amistad con el míster pero no se consigue adaptar a la categoría y abandona la disciplina del club antes de acabar la temporada. El equipo acaba subcampeón del grupo II y en el play off de ascenso elimina al Alcoyano en los penaltis en la primera eliminatoria pero no puede hacer lo mismo en la segunda y definitiva eliminatoria ante el filial Sevilla Atlético, quedando eliminado el cuadro burgalés con un gol en la prórroga (1-0 gol de Lolo) en un partido disputado en el estadio Sánchez Pizjuán.

La temporada 2007/08 estuvo marcada por la austeridad económica. La falta de dinero produce la realización de fichajes con el fin de salvar la categoría únicamente. Félix Arnáiz Lucas comienza la temporada en el banquillo manteniendo al equipo en la zona media pero a la directiva no le convence y es sustituido por el entrenador del filial por aquel entonces, Alberto González, que no consigue mejorar los resultados y acaba presentando la dimisión. Le sustituye al final de la temporada Raúl González que no evita el desastre y el club acaba descendiendo a la Tercera División en la última jornada tras un empate 1-1 en la Nueva Balastera ante el CF Palencia.

Consolidación económica (2009-2016)

Tras el descenso a Tercera División, el club estuvo a punto de descender a categorías regionales por impago a varios futbolistas. Un grupo de empresarios encabezados por el empresario hotelero Juan Carlos Barriocanal negocia con Domingo Novoa su salida del club. La nueva Junta Directiva se plantea dos objetivos claros e irrenunciables; el primero y el más importante, es el saneamiento económico del club y el siguiente la consolidación y crecimiento deportivo. Tras negociar con los jugadores impagados, el club consigue que retiren las denuncias y así poder competir en Tercera División. Así comienza la temporada 2008/09. Entrenado por Javier Álvarez de los Mozos, el equipo queda en tercera posición del grupo VIII. En el play off de ascenso, es eliminado por el Sporting Mahonés en la segunda eliminatoria, después de haber apeado al conjunto vasco del Elgoibar en la primera.

En la temporada 2009/10, el Burgos CF ganó su séptimo título de campeón de Tercera División. En los play offs de ascenso, quedó emparejado con el filial del Deportivo de la Coruña, el Depor "B", perdiendo la eliminatoria en el partido de vuelta en el estadio de Riazor en la tanda de penaltis; pero al haber acabado la liga como líder de grupo, al Burgos CF todavía se le concede otra oportunidad de ascenso en caso de ganar otras dos eliminatorias más. En la primera de ellas, queda emparejado con otro filial, esta vez el del Almería, el Almería "B", quedando nuevamente eliminado y quedándose una temporada más sin el premio del ascenso.

En la siguiente temporada 2010/11, la tercera consecutiva del equipo tras el último descenso y con Carlos Tornadijo en el banquillo, el equipo comienza muy fuerte y pronto se pone líder; pero al comienzo de la segunda vuelta, el equipo empieza a encadenar una serie de resultados negativos que acaban con la destitución del entrenador buscando la directiva un revulsivo en la persona de Julio Bañuelos, quien enderezó el rumbo y consiguió proclamar al equipo nuevamente campeón del grupo VIII consiguiendo el octavo título de Tercera División. El broche de oro a la temporada llegó con el ascenso a Segunda División B tras eliminar a la UD Lanzarote en el play off de ascenso, en un Estadio Municipal de El Plantío que vibró con su equipo como hacía muchos años que no lo hacía.

La temporada 2011/12 en Segunda División B fue nefasta para el club. El presidente Juan Carlos Barriocanal decide fichar a un director deportivo, Juan Manuel Barroso, una figura que es un lujo innecesario para esta categoría. Pronto empiezan los problemas entre el entrenador Julio Bañuelos y el director deportivo en la confección de la plantilla. Juan Manuel Barroso, avisado por el presidente para que haga una plantilla lo más barata posible, empieza a fichar jugadores sin consultar con el entrenador y vienen futbolistas mediocres que la temporada anterior habían descendido con sus equipos a la Tercera División. Tras rozar el esperpento en la primera vuelta del campeonato, Barroso es despedido y poco después le sigue el entrenador Julio Bañuelos. Miguel Ángel Álvarez Tomé es fichado como entrenador en la jornada 9 con la esperanza de un imposible: salvar al equipo del descenso. En el mercado de invierno y con el equipo hundido en la tabla, el presidente decide descuidar el aspecto económico y junto con el entrenador opta por fichar a 10 nuevos jugadores con la esperanza de dar un vuelco a la situación y al menos no hacer el ridículo como se había hecho hasta ahora. El resultado fue el evidente de la mala gestión tanto económica como deportiva llevada a cabo por la directiva y el equipo acaba descendiendo a la Tercera División quedando último del grupo II.

En la temporada 2012/13, el club tiene como única meta el ascenso a la Segunda División B. Se confecciona una plantilla competitiva con jugadores profesionales. Pronto el equipo se pone líder del grupo VIII de la Tercera División y ya no lo soltaría hasta el final de liga, consiguiendo el noveno título de esta división en la historia del club. En el play-off de ascenso para campeones de grupo, queda encuadrado con el equipo malagueño del Centro de Deportes El Palo, ganando la eliminatoria por un cómputo global de 3-2 y consiguiendo un nuevo ascenso a la Segunda División B.

Para la temporada 2013/14 en Segunda División B la única meta del club era conseguir la permanencia en la categoría. Se confecciona una plantilla barata pero con algunos jugadores de calidad. Tras una primera vuelta en la que el equipo se hace fuerte en casa consiguiendo varias victorias consecutivas, coquetea con los puestos de play-off de ascenso a la Liga Adelante. Tras la primera vuelta, el equipo prácticamente había conseguido el objetivo de la permanencia y en el mercado de invierno, el equipo apenas se refuerza. La directiva hace ver a la masa social y a los propios jugadores que el objetivo de la temporada estaba cubierto por lo que el rendimiento de la plantilla fue descendiendo de tal forma que acabó la temporada en una conformista décima posición y tras varias derrotas consecutivas en el tramo final de la competición. Al finalizar la temporada se anuncia el adiós de Ramón Calderé, el entrenador que consiguió el ascenso el año anterior y la permanencia en la división de bronce del fútbol español.

La temporada 2014/15, el club confía el equipo al entrenador Fede Castaños. Se hace una plantilla de perfil medio para mantener la categoría. Tras unos inicios titubeantes, el equipo empieza a mirar a los puestos bajos de la clasificación, cayendo en la 11.ª jornada a puestos de descenso directo a Tercera División. Al no mejorar la situación, el club decide destituir al entrenador al acabar la primera vuelta y dar el testigo a Gonzalo Arconada. Los resultados mejoran sensiblemente, sobre todo al potenciar la faceta defensiva y evitando la sangría de goles que se estaba produciendo con el anterior entrenador. Tras una mediocre temporada y con la afición pidiendo la dimisión de la junta directiva en la mayoría de los partidos jugados como local, se consigue la salvación a falta de 2 partidos para finalizar la liga. El equipo acaba 12.º.

La temporada 2015/16, el equipo es dirigido por Ángel Viadero, que hace las veces tanto de entrenador como de director deportivo. El presidente le encomienda que haga una plantilla competitiva pero con poco presupuesto, ya que la política austera del presidente desde que tomó el mando del club, hace que para la confección de la plantilla destine un porcentaje muy pequeño del presupuesto anual total, siendo este uno de los más altos de toda la Segunda División B, con el fin a largo plazo de ir reduciendo la pequeña deuda que arrastra el club desde hace años. Tras un año irregular y tras un gran final de temporada, el equipo acaba en 5.ª posición, pero muy alejado de los puestos de play-off de ascenso a Segunda División.

En la temporada 2016/17, el club sigue militando en el grupo I de Segunda División B. El entrenador para dirigir el proyecto es el mismo que acabó la temporada anterior, Ángel Viadero. En pretemporada, el Racing de Santander se pone en contacto con el entrenador y este acepta la oferta de los cántabros. Tras pagar la cláusula de rescisión, Ángel Viadero se despide del equipo y el club busca nuevo entrenador, encontrándolo en la figura de Paco Fernández. Se conforma una plantilla para estar en los puestos altos de la clasificación, pero el comienzo no puede ser más nefasto y el equipo consigue 1 punto en 6 partidos disputados, además de ser eliminado en la primera ronda de la Copa del Rey a manos del Caudal Deportivo. El entrenador, Paco Fernández, es destituido con el equipo hundido en la tabla. Su sustituto es Manix Mandiola.

Presidencias de José Luis García y Jesús Martínez Nogal (2016-2019)

El sábado 17 de diciembre de 2016 se celebraron las primeras elecciones a la presidencia del club desde su refundación en el año 1994. En todas las anteriores sólo había habido un candidato a la presidencia y ésta era la primera vez que había más de uno. A ellas se presentaron Angélica Basurto y José Luis García con dos candidaturas bastante similares respecto a objetivos (profesionalización del club, conversión en S.A.D., ascenso a Segunda División, fundación para potenciar la cantera, creación de una ciudad deportiva, etc.) pero, entre las cuales, la de José Luis García destacaba por la experiencia y la capacidad económica de los directivos que llevaba junto a él.

José Luis García se impuso en unas elecciones a las que acudió a votar un 55,72% del censo electoral (formado por 2630 de los 2990 socios que existían en aquel momento), que hizo un total de 1470 votos.​

• "Ahora sí, J.L. García": 813
• "Basurto BCF": 643
• En blanco: 13
• Nulo: 1

El domingo 18 de diciembre de 2016, se jugó el partido correspondiente a la jornada 19 de liga contra el CD Boiro, encuentro que concluyó con el resultado de 0-2 para el cuadro gallego y que supuso el último partido de Juan Carlos Barriocanal como presidente del Burgos Club de Fútbol. Así se cerró un período de 8 temporadas en las que este presidente logró salvar al club albinegro, reduciendo la deuda que arrastraba desde el año 2009, pero sin apenas conseguir éxitos deportivos. Cogió al club en Tercera División y vivió dos ascensos y un descenso, dejándolo en Segunda División B.

No fue hasta el martes día 20 de diciembre de 2016 cuando la candidatura tomó las riendas del club blanquinegro iniciando así una nueva era que comenzaría con el nuevo año 2017 correspondiendo a la segunda vuelta de la temporada.​

El equipo realiza entonces un magnífico mes de enero en el que consigue 10 puntos en 4 partidos y la nueva junta directiva incorpora tres jugadores importantes. El equipo abandona la zona de descenso pero un mal final de liga hace que acabe en el puesto 16.º, teniendo que jugar el play-out de descenso a la Tercera División. El rival tras el sorteo es el Linares Deportivo y tras el 0-0 cosechado en el Estadio Municipal de El Plantío, el equipo se salva en Linarejos, tras vencer por 1-2.

La temporada 2017/2018 comienza con Patxi Salinas como entrenador. Tras un buen inicio de liga, llegando a ser líder del grupo II de Segunda División B, el equipo comienza a perder posiciones. Este motivo lleva a destituir al técnico vasco, que es sustituido por Nacho Fernández de forma interina y por Alejandro Menéndez de forma definitiva.

Esta temporada se aborda la conversión del club en Sociedad Anónima Deportiva, quedando inscrita como con el registro número 137.

La temporada 2018-19 es de continuo sufrimiento para el equipo que coquetea todo el año con el descenso. A cuatro jornadas para el final cae a posición de promoción de permanencia. Finalmente, tres victorias consecutivas contra rivales directos permiten salvar in extremis la categoría.

En diciembre del 2018 a través de la Junta general de accionista asume Jesús Martínez Nogal como presidente de la institución hasta diciembre de 2019. El 2 de diciembre, la Junta General de Accionistas del Burgos CF nombró presidente a Franco Caselli de manera unánime. Con 23 años y 364 días, Franco se convirtió en el presidente más joven del fútbol español.​​​

Desembarco de la familia Caselli y ascenso a Segunda División (2019-2021)

En mayo de 2019, el empresario y dirigente del fútbol argentino Antonio Caselli adquirió el 90% de las acciones del Burgos Club de Fútbol. En diciembre de ese mismo año, su hijo Franco fue nombrado por la Junta General de Accionistas del Burgos CF como presidente de la institución.

En la era de los Caselli se relanzó la Fundación Burgos Club de Fútbol, a cargo de Julián Alonso y Candela Blanco. También finalizaron las reformas en El Plantío, donde se abrieron la nueva Lateral y el Fondo Norte.​

A su vez, el Burgos Club de Fútbol y el Club Deportivo Nuestra Señora de Belén firmaron un acuerdo para crear el primer equipo femenino, que a partir de la temporada 2020 militaría en la Segunda División del Fútbol Femenino.​

A partir de la temporada 2019/20 la RFEF obliga a llevar nombre de los jugadores y dorsales fijos en las camisetas de los clubes participantes.​

Pese a la ilusión generada en torno al renovado proyecto blanquinegro, los resultados no terminaron de llegar en el inicio de la campaña 19/20. El técnico Fernando Estévez, artífice de la salvación durante la anterior campaña, fue destituido y su lugar en el banquillo lo ocupó José María Salmerón. El Burgos CF finalizó el año 2020 en la decimocuarta posición del Grupo 2, con seis partidos ganados, cinco empatados y nueve perdidos.

El exfutbolista de talla internacional Miguel Pérez Cuesta, Michu, fue contratado como director deportivo después que la familia Caselli perdiera la confianza en el argentino César Traversone, también cesado de sus funciones.​
La llegada del asturiano motivó la salida de algunos futbolistas y, a su vez, la contratación de varios fichajes que contribuyeron a mejorar la dinámica del equipo. A partir del mercado invernal, el Burgos encadenó una serie de resultados positivos que le hicieron soñar incluso con la posibilidad de alcanzar los puestos de play-off de ascenso a Segunda División.

Sin embargo, en el mes de marzo, la competición se suspendió por el brote de la pandemia de COVID-19. El 6 de mayo la RFEF anunció las medidas adoptadas entre las que destacan:

• Finalización del torneo regular dando por definitivas las clasificaciones de la jornada 28.
• La celebración de la promoción de ascenso en formato exprés, supresión de descensos.
• Ampliación de la categoría a cien equipos divididos en cinco grupos.
• Creación de una categoría intermedia entre Segunda División y Segunda División B para la temporada 2021-2022.​​​

En ese momento, el equipo ocupaba la 8.ª posición, por lo que logró, al menos, clasificarse para la Copa del Rey del año próximo.

En la temporada 20/21, ya con Michu como arquitecto de la plantilla, la apuesta por lograr el ansiado ascenso se redobló. Para ello, el Burgos apostó por el madrileño Julián Calero como entrenador. Esta vez, el rendimiento del equipo sería brillante desde el inicio del campeonato. Tras clasificarse para la nueva Primera RFEF, el conjunto burgalesista concluyó primero de su grupo en la última fase, lo que le valió el billete para la Fase Final por el ascenso que se decidiría, en una única sede, en Extremadura. El Burgos derrotó al CD Calahorra en semifinales y al Athletic de Bilbao B en la final disputada en el Francisco de la Hera, con un gol de Saúl Berjón en el minuto 107 de la prórroga, logrando un histórico y esperado ascenso a la Segunda División, después de 20 años de peregrinación por las categorías más bajas del fútbol español.

Inicios de la vuelta a la Segunda División (2021-2023)

Tras la vuelta a la segunda división, Michu y Julián Calero confeccionaron una plantilla con el objetivo de aguantar y lograr la salvación en su vuelta a la categoría. Tras una aceptable temporada, el equipo blanquinegro finalizó en undécima posición tras estar fuera de los puestos de descenso durante la mayoría de la temporada.

En la siguiente temporada, 2022-2023, de nuevo Michu junto con su ayudante, el técnico de la casa, Óscar del Río, Fosky, lograron hacer una plantilla para consolidar al equipo en la categoría aún a sabiendas que el objetivo seguía siendo la salvación. En el primer tercio de la temporada, el Burgos realizó un gran comienzo logrando el liderato tras la jornada decimocuarta logrando además el récord de imbatibilidad de su portero, José Antonio Caro, e hizo que su equipo estuviese 928 minutos seguidos sin encajar un gol. De hecho, en el partido el que el equipo perdió la imbatibilidad, José Antonio Caro, fue expulsado y el gol que le marcó el Mirandés lo encajó el portero suplente Dani Barrio.